琼民源的全称为海南民源现代农业发展股份有限公司，其前身参股股东民源公司系经海南省工商行政管理局登记注册的全民所有制企业，始创于1988年7月。1991年海南省体制改革办公室同意以民源公司为主筹建该公司，并按海南省人民政府(1991)39、4O号文件所规定的程序，进行规范化股份制试点。琼民源是以美亭农业科技开发试验区为项目组织筹建的。试验区管理委员会于1991年1月经海南省人民政府农业综合开发试验区管理委员会批准成立。1991年8月，海南省人民政府和中国科学院联合发文上报国务院，建议批准将该试验区列为国家农业科技开发试验区，同年9月，海南省人民政府体制改革办公室批准以试验区为项目筹建成为海南民源现代农业发展股份有限公司。